中国医药设备工程协会机构设置
根据国家民政部《社会团体登记管理条例》、《全国性社会组织评估管理规定》，以及中共中央《关于加强社会组织党的建设工作的意见》、《社会组织党建工作承诺书》等相关文件要求，在国家民政部和上级党委的领导下，中国医药设备工程协会根据协会自身业务特点和工作范围，协会秘书处成立了党支部，设立了专家委员会，并结合协会业务范围和工作职能，以及医药行业产业专业化特点、发展需要，陆续成立了多个专业委员会（分支机构）。
协会专家委员会（智库）由原国家食品药品监督管理局副局长张文周先生领衔，发挥了产业智囊的高端学术引领和专业服务作用。
协会现有8个专业委员会：医药环境工程（EHS）专业委员会、吹灌封技术(BFS)专业委员会 、仿制药技术专业委员会、中药设备工程技术专业委员会、原料药先进制造专业委员会、无菌药品先进制造专业委员会、医药自动化专业委员会等
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